宏基因组是指特定环境中全部生物（微生物）遗传物质的总和。宏基因组测序即利用测序技术对环境样品中全部微生物的基因组进行测定，以分析微生物群体的基因组成及功能，解读微生物群体的多样性和丰度，探索微生物与环境及宿主之间的关系，发掘和研究新的具有特定功能的基因等。目前，第二代高通量测序技术在宏基因组的研究上已被广泛应用。与传统方法相比，基于高通量测序的宏基因组研究无需构建克隆文库，这避免了文库构建过程中利用宿主菌对样品进行克隆而引起的系统偏差，简化了实验操作，提高了测序效率，从而极大地促进了宏基因组学的发展。 16S/18S rDNA测序与宏基因组测序的区别：16S/18S rRNA基因测序以细菌16S rRNA 或者真菌18S rRNA 基因测序为主,核心是研究样品中的物种分类、物种丰度以及系统进化。宏基因组测序以环境样品中的微生物群体基因组为研究对象，直接从环境样品中提取全部微生物的DNA，构建宏基因组文库，利用高通量测序技术分析环境样品所包含的全部微生物的群体基因组成及功能和参与的代谢通路，解读微生物群体的多样性与丰度，探求微生物与环境，微生物与宿主之间的关系，发掘和研究新的、具有特定功能的基因。 拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台，实验周期短，质量可靠。 拥有Illumina HiSeq 2500、MiSeq等多种高通量测序平台。 技术人员经验丰富，可以根据合作伙伴要求提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果。