一、实验背景
感冒?鼻炎?是不是真的会分不清楚~而且,你周围有鼻炎的小伙伴吗?小编弱弱的想了一下,周围就有俩鼻炎小伙伴!鼻炎也分种类的哦~过敏性鼻炎为变态反应性鼻炎的一种,是常见病、多发病。针灸治疗过敏性鼻炎的报道首见于1957年,随着相关研究的发展,针灸治疗本病的平均有效率为95%左右。So 还是我们中医疗法厉害,哈哈~
二、实验目标
1.利用外泌体小RNA测序,分析针灸治疗过敏性鼻炎小鼠模型(人)后外泌体microRNAs的表达变化;
2.研究针灸治疗过敏性鼻炎的分子基础和内在机制。
三、实验分组
实验材料和分组
(1)以过敏性鼻炎小鼠模型为研究对象
分组:a:普通用药组
b:过敏性鼻炎小鼠治疗空白对照组
c:针灸治疗组
(2)以过敏性鼻炎病人为材料研究对象
分组:a: 针灸治疗前(自身空白对照组)
b: 针灸治疗组(针灸治疗有效组)
c: 普通用药组
d: 针灸无效组 (指标:症状改善、趋化因子)
四、实验处理
(1)以过敏性鼻炎小鼠模型为研究对象:
① 选取同窝出生的小鼠,经相同的饲养条件,选取18只体重,健康状况无明显差异的小鼠,用同样的方法对小鼠 进行过敏性鼻炎造模;
② 对造模成功的小鼠随机分成三组:一组采用针灸治疗过敏性鼻炎;一组采用西替利嗪片+布地奈德鼻喷剂配合治疗;另外一组则作为空白对照组;
③ 在针灸和药物组治疗有显著疗效后,处死小鼠取血清样本;
(2) 两种不同研究对象的实验设计注释:
① 外泌体测序需要约 5 ml 的全血,对小鼠而言,取血量5 ml即使不至死也对小鼠的免疫系统造成非常大的影响,所以在小鼠实验中用空白对照组代替治疗之前的组。而对人而言,取血5ml对免疫系统无显著影响,故可在治疗之前全部采集一次外周血,形成治疗之前/治疗之后的比较组。
② 针灸治疗的有效率约为95% ,针灸治疗组可选取治疗有效的人,故针灸治疗组和针灸有效组为同一组。
五、实验分析
1.分析比较miRNA 差异表达方案
小鼠实验:
① 针灸治疗组 vs 空白对照组:分析过敏性鼻炎小鼠经针灸治疗与未经治疗的外泌体miRNA 的差异,找出针灸治疗引起的显著差异表达外泌体miRNAs。
② 普通用药组 vs 空白对照组:找药物疗引起的显著差异表达外泌体miRNAs
③ 取以上两个比较组显著差异表达的miRNAs 交集,找到针灸治疗和药物治疗共同改变的miRNAs,进一步研究治疗的分子基础。
④ 取①相对②显著差异的miRNAs,进一步研究针灸治疗相对于药物治疗独立的分子通路。
过敏性鼻炎病人实验:
分析思路与小鼠相同。
增加针灸无效组和针灸有效组差异miRNAs分析。
2.显著差异miRNAs 表达量验证
高通量测序分析得到的差异表达miRNAs 需要qRT-PCR验证。
3.miRNAs 功能研究实验
①运用化学方法合成的miRNA模拟物,能模拟细胞中成熟miRNA的高水平表达,以增强内源性miRNA的调控作用,进行细胞功能获得性(gain-of-function)研究.
②运用化学方法合成的miRNA抑制剂,可通过与成熟miRNA分子特异性结合而削弱细胞中内源性miRNA导致的基因调控作用,进行miRNA功能缺失性(loss-of-function)研究。
六、重要生信分析介绍——GO富集性柱状图
Gene Ontology(GO)分析可以对每一个基因进行功能注释。一方面通过富集的GO注释条目,可以整体性地把握基因差异表达谱对应的潜在功能,从而找到不样本差异表达miRNAs与哪些细胞功能。
图 GO 分析靶基因
今天的外泌体研究方案分析就到这里了,你有什么好想法吗?有没有受到一点启发呢?
有想了解这方面的小伙伴,可以联系小编哦~坐等你的到来!