温医大王慧利组6连发,他们做了啥?-技术前沿-资讯-生物在线

温医大王慧利组6连发,他们做了啥?

作者:联川生物技术公司 2017-01-05T11:14 (访问量:4059)

今天向大家隆重介绍联川的长期合作伙伴,一个非常高产的课题组,在环境微生物学和环境毒理学方面颇有建树,他们是——温州医科大学王慧利教授课题组

王慧利教授简介

温州医科大学生物学教授,主要从事环境微生物学和环境毒理学两方向的研究工作。主持国家自然科学基金3项,主持和参与省厅级项目多项。近年来,发表相关学术论文40余篇,其中SCI 30余篇,获得发明**4项。多次成功指导学生参加省级生命学科竞赛及申报省大学生新苗人才计划项目。


下面我们就一起来看看,近年来,王教授课题组发表的6项代表性成果。联川为王教授课题组提供高通量测序与数据分析支持。


一、钝顶螺旋藻性相关microRNA-size sRNAs的鉴定

Identification of microRNA-size sRNAs Related to Salt Tolerance in Spirulina platensis

期刊Plant Molecular Biology Reporter

IF:2.304

年份2015

物种:钝顶螺旋藻

联川提供服务miRNA测序ACGT101-miR数据分析

通过对三种不同浓度0.02M,0.3M0.5 M)NaCl处理下的钝顶螺旋藻进行RNA测序,验证msRNAs表达量,预测其靶基因,并通过GO和KEGG分析靶基因相功能利用蛋白质组学分析两个靶标蛋白质甘油醛-3-磷酸脱氢酶forkhead-associated (FHA) domain-containing protein),其功能表达可能msRNAs调控

研究结论

钝顶螺旋藻存在msRNAs这些msRNAs可能盐胁迫中发挥重要作用,但其功能意义需要进一步研究


二、转录组测序分析β-双酮类抗生素对斑马鱼的慢性毒性影响

Chronic Toxicological Effects of β-Diketone Antibiotics on Zebrafish (Danio rerio) Using Transcriptome Profiling of Deep Sequencing

期刊:Environmental Toxicology

IF:2.868

年份:2015

物种:斑马鱼

联川提供服务:转录组测序

研究内容:

研究斑马鱼在长期低剂量β-双酮类抗生素药物(DKAs)胁迫下,所出现的差异表达基因,并通过qPCR及GO和KEGG通路分析,同时做了HE病理肝脏组织切片染色,从分子角度初步论证了药物痕量暴露下对斑马鱼的毒性影响。

研究结论:

为建立系统毒理学模型提供了基础,推进进一步阐述DKAs的生态风险和药源性疾病治疗。


三、β-双酮类抗生素胁迫斑马鱼lncRNAs的筛选和功能鉴定

Screening and functional identification of lncRNAs under β-diketone

antibiotic exposure to zebrafish (Danio rerio) using high-throughput

sequencing

期刊Aquatic Toxicology

IF:3.557

年份2016

物种:斑马鱼

联川提供服务lncRNA测序

研究内容

通过研究斑马鱼在长期低剂量β-双酮类抗生素药物(氧氟沙星、环丙沙星、恩诺沙星、强力霉素金霉素、土霉素;另称DKA)胁迫下所出现的lncRNAs的差异表达及其功能分析,利用原位杂交技术,结合HE病理切片观察,从分子角度初步论证药物痕量暴露下对斑马鱼各系统的影响。

研究结论:

DKAs胁迫导致的一些异常表达lncRNAs及其靶基因斑马鱼免疫系统中扮演了一个重要的调节功能。这进一步研究环境压力胁迫下lncRNAs及其靶基因之间的交互作用,分析lncRNAs功能具有重要意义。


四、转录组分析斑马鱼β-双酮类抗生素混合物免疫毒性

Immunotoxicity of β-Diketone Antibiotic Mixtures to Zebrafish (Danio rerio) by Transcriptome Analysis

期刊PLoS ONE

IF:3.057

年份2016

物种:斑马鱼

联川提供服务:转录组测序

研究内容:

通过研究长期暴露在六种β-酮类抗生素DKAs)混合药物,不同浓度0, 6.25, 12.5, 25 and 50 mg/L)至性成熟的斑马鱼分析其免疫相关基因的差异表达,以及主要免疫器官小肠和脾脏的生理病理学变化,从分子角度初步论证了药物痕量暴露下对斑马鱼免疫系统的影响。

研究结论:

DKAs长期胁迫下会对斑马鱼的免疫系统产生严重影响。


五、斑马鱼β-酮类抗生素胁迫下差异表达miRNAs分子的筛选及其功能研究

Screening on the differentially expressed miRNAs in zebrafish (Danio rerio) exposed to trace β-diketone antibiotics and their related functions

期刊Aquatic Toxicology

IF:3.557

年份2016

物种:斑马鱼

联川提供服务:miRNA测序

研究内容

研究斑马鱼在长期低剂量β-酮类抗生素药物(DKAs)胁迫下,所出现miRNAs的差异表达,通过qPCR及整胚、切片原位杂交技术,进行了时空表达验证,同时针对其可能影响到的靶器官进行了HE组织病理学染色,从分子角度初步论证了药物痕量暴露下对生物体的影响。

研究结论

DKAs的长期胁迫对斑马鱼具有广泛的毒理学效应


六、测序分析β-双酮类抗生素胁迫下对斑马鱼F1代的影响

Effects of b-diketone antibiotics on F1-zebrafish (Danio rerio) based on high throughput miRNA sequencing under exposure to parents

期刊Chemosphere

IF:3.698

年份2016

物种:斑马鱼

联川提供服务miRNA测序、ACGT101-miR数据分析

研究内容

研究斑马鱼在长期低剂量β-酮类抗生素药物胁迫下,子一代所出现miRNAs的差异表达,通过qPCR及整胚、切片原位杂交技术,进行了时空表达验证,同时针对其对子一代的影响情况在亲本精巢与卵巢中做了HE病理组织切片染色与原位杂交分析以及对应的生理病理学变化,从分子角度初步论证了药物痕量暴露下对斑马鱼性腺及子代的影响。

研究结论:

DKAS胁迫下将会对斑马鱼的生殖系统产生毒性。

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